据《清镇县志》记载：“东山古寺有三体三层，中层有岩，大数十围，岩下有洞，外狭内阔，旧传有仙佛居此……”。后因山顶有一奇石形如一只蹲在巢穴中的凤凰而得名。故名“巢凤寺”。

　　巢凤寺周边风景秀丽，古柏参天，树木葱茏，特别是在晨曦初上、夕阳西下时，景色如画。该寺始建于明初，几经毁坏和重修，八十年代初，该寺被清镇县政府列为重点文物保护单位。2002年，遗址被列为清镇市21处县级文物保护单位之一，2003年底，恢复重建巢凤寺，第一期工程于2005年5月15日圆满完成，大雄宝殿、天王殿顺利竣工，并在此举行了佛像开光大典以及系列的法会活动。

　　现巢凤寺傍山而建，总共分为三层，最上层是藏经阁旧址，也就是现在的观光亭；中层是大雄宝殿，左右厢房，中央是久负盛名的“巢凤石”；下层是天王殿，左右是钟楼鼓楼，整个格局构成“四合院”。数百年以来，巢凤寺香火旺盛，古寺、巨杉、亭池之间曲径通幽，并载负着巢凤石的灵气，周围的百姓世代风调雨顺，民富平安，堪称黔中圣地。

　　巢凤寺的名字因山顶的这块巢凤石而来。这块灵石不仅给周围的百姓带来世代风调雨顺的生活，而且还有冬不覆雪的灵性，因雷击，附着巢凤石旁生长的一株百年古树被击毁，只留下碳黑的老根，但因凤凰秉载着“新生、再生、重生，生生不息”的涅盘精神，今天，一株新苗又从巢凤石的旁端正茁壮成长着，象征着凤凰的新生，再生的精神，也开创了今天巢凤寺“东山再起，古刹重辉”的新局面。